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农村自建房有房产证，在城市买房子就不能算第一套房即首套房了。
不管在哪里买房，都要缴纳契税，买首套房缴纳的税比买第二套房子缴纳的税少一点，缴纳税之前，税务部门都要求提供户口所在地的房产证明?。
证明上就会记载房产登记情况：有几套房子或者无房 ，农村的自建房也是房产之一，有房产证不动产登记部门都是查询得到的。
建房简介：
自建房需要注意的问题：
一、 自建房要选择好的建造团队，要有建筑草图。
二、自建房要监工保障，保证建房质量，要准备钢材，砖瓦，水泥等材料。
三、自建房要建房涉及到占用公共道路的问题，要处理好邻里关系。要写一张建筑合同，这样遇到纠纷的时候才能有据可谈，避免出现纠纷问题。
四、自建房要设计好地下管道问题，一劳永逸，要不然麻烦大了。
五、自建房不要忘了线路铺设。要保证墙体垂直。
六、自建房要准备门窗，好预留门窗大小。